Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXYD4P59646 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms