Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABP4P57796 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABP4P57796 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABP4P57796 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABP4P57796 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms