Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF3P57682 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms