Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPAP53621 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPAP53621 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPAP53621 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPAP53621 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPAP53621 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPAP53621 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPAP53621 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPAP53621 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPAP53621 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COPAP53621 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COPAP53621 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COPAP53621 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COPAP53621 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COPAP53621 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COPAP53621 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPAP53621 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPAP53621 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPAP53621 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPAP53621 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPAP53621 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPAP53621 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPAP53621 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms