Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX2P52951 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms