Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORCP51449 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORCP51449 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORCP51449 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RORCP51449 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RORCP51449 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RORCP51449 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RORCP51449 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RORCP51449 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms