Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP9P49458 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms