Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TGM4P49221 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms