Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNI2P48788 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms