Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX5P48382 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX5P48382 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX5P48382 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX5P48382 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX5P48382 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX5P48382 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX5P48382 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX5P48382 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms