Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms