Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AFMP43652 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AFMP43652 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AFMP43652 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AFMP43652 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AFMP43652 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AFMP43652 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AFMP43652 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AFMP43652 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AFMP43652 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AFMP43652 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AFMP43652 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AFMP43652 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AFMP43652 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AFMP43652 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AFMP43652 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms