Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF5P43026 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF5P43026 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF5P43026 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF5P43026 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF5P43026 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF5P43026 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF5P43026 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF5P43026 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF5P43026 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF5P43026 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms