Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC1P41238 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC1P41238 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms