Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms