Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPS1P31327 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPS1P31327 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CPS1P31327 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CPS1P31327 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CPS1P31327 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPS1P31327 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms