Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH4A1P30038 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALDH4A1P30038 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms