Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBL1P28749 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBL1P28749 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBL1P28749 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBL1P28749 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBL1P28749 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBL1P28749 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBL1P28749 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBL1P28749 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBL1P28749 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBL1P28749 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms