Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHATP28329 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHATP28329 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHATP28329 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHATP28329 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHATP28329 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHATP28329 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHATP28329 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms