Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms