Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms