Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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