Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APCP25054 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APCP25054 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APCP25054 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APCP25054 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APCP25054 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APCP25054 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APCP25054 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APCP25054 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APCP25054 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APCP25054 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APCP25054 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APCP25054 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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APCP25054 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APCP25054 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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