Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSHP23434 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GCSHP23434 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GCSHP23434 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GCSHP23434 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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