Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT1P21579 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT1P21579 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT1P21579 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT1P21579 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms