Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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