Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms