Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB1P16220 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms