Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD46P15529 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD46P15529 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD46P15529 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD46P15529 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD46P15529 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD46P15529 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD46P15529 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD46P15529 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms