Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms