Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms