Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms