Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms