Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms