Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms