Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTXN2P0C2S0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms