Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP10P09238 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP10P09238 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP10P09238 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP10P09238 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP10P09238 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP10P09238 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP10P09238 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP10P09238 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP10P09238 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP10P09238 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP10P09238 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP10P09238 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP10P09238 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP10P09238 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms