Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGAP02671 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGAP02671 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGAP02671 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGAP02671 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGAP02671 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGAP02671 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGAP02671 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGAP02671 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGAP02671 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGAP02671 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms