Protein–RNA interactions for Protein: P01213

PDYN, Proenkephalin-B, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDYNP01213 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PDYNP01213 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDYNP01213 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDYNP01213 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDYNP01213 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDYNP01213 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDYNP01213 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDYNP01213 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDYNP01213 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDYNP01213 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDYNP01213 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms