Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIC3O95833 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIC3O95833 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIC3O95833 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIC3O95833 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIC3O95833 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIC3O95833 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIC3O95833 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms