Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG7O95352 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms