Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DYSFO75923 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DYSFO75923 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms