Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms