Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP3O75154 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms