Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms