Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms