Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYT7O43581 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYT7O43581 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT7O43581 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms