Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1GO43497 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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