Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGFO15240 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGFO15240 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGFO15240 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VGFO15240 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VGFO15240 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VGFO15240 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VGFO15240 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VGFO15240 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGFO15240 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms