Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD28O15084 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms